進出３種港口通報方式：一般港口、遊艇港、漁港
- 一般港口
遊艇進入商港，應於到達港區24小時前，出港應於12小時前由駕駛人、遊艇所有人或其代理人填具遊艇通報單以網路、傳真或書面向航港局通報。 - 遊艇港
申報程序同一般港口。 - 漁港
遊艇依規定進出漁港者，應填具申請書於進港3日前，向主管機關(各縣市政府)申請核准。
如何進、出港
遊艇駕駛人、遊艇所有人或其代理人，應於到達遊艇港或其化航政機關公告之港變口岸24小時內申報關務、入出境、檢疫及安全檢查相關入境手續。前述遊艇入、出境資料應轉通報關務、入出境、檢疫、安全檢查相關機關及港灣口岸管理機關(構)後，遊艇始得入、出港。
重行通報
經第一項之通報後，超過7天遊艇未入境者，應依第一項規定重行通報。
國內港口多港進出
遊艇完成入境之關務、入出境、檢疫及安全檢查相關手續後，繼續航行靠泊我國其他經許可之港灣口岸者，除涉及出境者外，得不再辦理關務，入出境及檢疫作業。
停泊費用
- 商港及遊艇港依各管理機關/單位所訂標準收費。
- 漁港每噸20元/天。
遊艇港
1.龍洞遊艇港
- 管理機關：交通部觀光局東北角暨宜蘭海岸國家風景區管理處龍洞站
- 地址：新北市228貢寮區福隆里東興街33號
- 電話：(02)2499-1115 #130
2.布袋遊艇港
- 管理機關：嘉義縣文化觀光局
- 地址：613嘉義縣朴子市山通路7號2樓
- 電話：(05)379-9056 #225
3.後壁湖遊艇碼頭
- 管理機關：內政部營建署墾丁國家公園管理處
- 地址：屏東縣恆春鎮墾丁路596號
- 電話：(08)886-1321 #4321
可供遊艇停泊之漁港｜行政院農業委員會漁業署公告
1.基隆市碧砂、八斗子漁港
- 基隆市政府產業發展處 漁業行政科 02-242-78090 #123~133
- 進港通報 八斗子漁港安檢所 02-246-95201
2.宜蘭縣烏石漁港
- 規劃中
3.桃園縣竹圍漁港
- 桃園縣政府觀光行銷局 觀光產業科 03-332-2101 #5263、5264
- 新竹縣新竹漁港
- 新竹市政府產業發展處 漁業科
4.臺南市安平、將軍漁港
- 臺南市政府農業局 永華市政中心 臺南市漁港及近海管理所
5.高雄市鼓山、旗津、興達漁港
- 高雄市政府海洋局 漁港管理科 漁港辦公室電話
鼓山 07-532-3448
旗津 07-571-6764
興達港 07-698-7124
6.臺東縣新港、金樽漁港
- 臺東縣政府農業處 漁業科 089-343-209、089-332-362
- 新港漁港安檢所 089-854-562
- 金樽漁港安檢所 089-896-670
7.澎湖縣七美、吉貝、大果葉、沙港、通樑、後寮、赤崁、馬公第三漁港、龍門、岐頭
- 澎湖縣政府 工務處 港灣科 06-926-4047~8、06-927-4400 #710、711
